总包和施工单位的区别如下：

1. 工程开展程序不同：总承包模式的工作程序是：先进行建设项目的设计，待施工图设计结束后再进行施工总承包投标，然后再进行施工；而施工模式的工作程序是：先进行建设项目的施工，待施工图设计结束后再进行总承包投标，然后再进行施工。
2. 两者的合同关系不同：总承包模式的合同关系有两种可能，即业主与分包单位直接签订合同或者由施工总承包管理单位与分包签订合同；而采用施工总承包模式时，由施工总承包单位与分包单位直接签订合同。
3. 两者的承包范围不同：总包是对全部工程的承包，施工单位不一定能够对全部工程进行施工。